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Caracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitro

dc.contributor.advisorHolanda, Ioná Santos Araújo
dc.contributor.authorGomes, Izabelle Rodrigues Ferreira
dc.contributor.coadvisorAmbrósio, Márcia Michelle de Queiroz
dc.contributor.referee1Holanda, Ioná Santos Araújo
dc.contributor.referee2Silveira, Lindomar Maria da
dc.contributor.referee3Negreiros, Andreia Mitsa Paiva
dc.contributor.referee4Bordallo, Patrícia do Nascimento
dc.contributor.referee5Marbach, Phellippe Arthur Santos
dc.coverage.spatialMossoró
dc.date.accessioned2024-11-01T14:53:14Z
dc.date.available2024-11-01T14:53:14Z
dc.date.issued2023-07-14
dc.description.abstractobjetivo deste estudo foi o de caracterizar, em nível morfológico e molecular, isolados de C. tenuissimum, causador da mancha marrom, a sua interação com aboboreira e meloeiro, por meio de análises de patogenicidade, e avaliar o efeito de óleos essenciais no crescimento in vitro do patógeno. Para isso, foram coletadas folhas de abóbora e melancia, e folhas e frutos de meloeiro com lesões necróticas moderadas a severas, em regiões produtoras do Rio Grande do Norte, Brasil. Um total de doze isolados (quatro de abóbora, um de melancia e sete de melão) foram obtidos a partir de folhas e frutos sintomáticos. Os isolados foram submetidos a análises morfológicas em microscópio óptico e de varredura, extração de DNA de pelo método SDS, sequenciamento do DNA com os primers ITS 1 e 2 e, de parte do gene TEF1α, análise filogenética pelo método da Análise de Máxima Verossimilhança e análise da diversidade genética com 19 marcadores ISSR e dez RAPD. O potencial patogênico dos isolados em plantas de abóbora e melão foi avaliado em casa-de-vegetação pela metodologia de suspensões de esporos (106 conídios/ml−1). Para avaliar o controle do crescimento in vitro de dois isolados distantes geneticamente, foram testados três óleos essenciais: canela cássia (Cinnamomum cassia), capim limão (Cymbopogon citratus) e manjericão (Ocimum basilicum), em duas contrações (0,125% e 0,5%) cada. No estudo da diversidade genética ambos os marcadores ISSR e RAPD foram eficazes na identificação de similaridade genética dos isolados, e produziram polimorfismo percentual 98% e 100%, respectivamente. A análise do dendrograma em conjunto indicou a formação de oito grupos principais, onde o coeficiente de similaridade genética variou de 0,21 (CMX02 e CML10) a 0,48 (CML07 e CML08). Todos os isolados apresentaram potencial patogenico para as plantas de abóbora e melão, variando na severidade. Na avaliação in vitro, canela cássia e capim limão inibiram 100% do crescimento dos isolados CML06 e CML07, enquanto que óleo de manjericão a 0,125% inibiram 84% e 78%, respectivamente. O isolado CML07 também apresentou na análise de similaridade em conjunto a maior distância genética dos demais isolados, sugerindo, dessa forma, que esse isolado possui genes que atuam de forma diferenciada, e que a presença da variação genética observada pode estar associada à maior incidência da doença. Este é o primeiro relato do patógeno em áreas produtoras no Rio Grande do Norte e no Brasil para Cucurbitáceas
dc.description.abstract2The objectives of this study were to characterize morphologically and molecularly isolates of C. tenuissimum, which causes brown spot, to verify its interaction with gourd and melon, through pathogenicity analysis, and to evaluate the effect of essential oils on the in vitro growth of pathogen. For this, pumpkin and watermelon leaves, and melon leaves and fruits with moderate to severe necrotic lesions were collected in producing regions of Rio Grande do Norte, Brazil. A total of twelve isolates (four from pumpkin, one from watermelon and seven from melon) were obtained from symptomatic leaves and fruits. The isolates were submitted to morphological analyzes in optical and scanning microscopes, DNA extraction by the SDS method, DNA sequencing with primers ITS 1 and 2 and, of part of the TEF1α gene, phylogenetic analysis by the Maximum Likelihood Analysis method and genetic diversity analysis with 19 ISSR and ten RAPD markers. The pathogenic potential of isolates from pumpkin and melon plants was evaluated in a greenhouse using the spore suspension methodology (106 conidia/ml−1). To evaluate the in vitro growth control of two genetically distant isolates, three essential oils, cassia cinnamon (Cinnamomum cassia), lemon grass (Cymbopogon citratus) and basil (Ocimum basilicum), were tested in two contractions (0.125% and 0.5 %) each. In the study of genetic diversity, both ISSR and RAPD markers were effective in identifying the genetic similarity of the isolates, and produced percentage polymorphism 98% and 100%, respectively. The analysis of the dendrogram together indicated the formation of eight main groups, where the coefficient of genetic similarity ranged from 0.21 (CMX02 and CML10) to 0.48 (CML07 and CML08). All isolates showed pathogenic potential for pumpkin and melon plants, varying in severity. In the in vitro evaluation, cassia cinnamon and lemongrass inhibited 100% of the growth of isolates CML06 and CML07 while basil oil at 0.125% inhibited 84% and 78%, respectively. The CML07 isolate also showed a greater genetic distance from the other isolates in the joint similarity analysis, suggesting that this isolate has genes that act differently, and that the presence of the observed genetic variation may be associated with a higher incidence of the disease. This is the first report of the pathogen in producing areas in Rio Grande do Norte and Brazil for Cucurbitaceae
dc.description.physical59 p.
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior – CAPES
dc.format.mimetypepdf
dc.identifier.advisorLatteshttp://lattes.cnpq.br/2079609001869001
dc.identifier.authorLatteshttp://lattes.cnpq.br/2050952817764684
dc.identifier.bibliographicCitationGOMES, Izabelle Rodrigues Ferreira. Caracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitro. 2023. 59 f. Tese (Doutorado em Fitotecnia) – Universidade Federal Rural do Semi-Árido (UFERSA). Mossoró-RN, 2023.
dc.identifier.coadvisorLatteshttp://lattes.cnpq.br/5986626995999424
dc.identifier.doihttps://doi.org/10.21708/bdtd.ppgfito.tese.11988
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufersa.edu.br/handle/prefix/11988
dc.language.isopt_BR
dc.publisher.centerCentro de Ciências Agrárias - CCA
dc.publisher.countryBrasil
dc.publisher.initialsUFERSA
dc.publisher.institutionUniversidade Federal Rural do Semi-Árido
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Fitotecnia
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.holderUFERSA
dc.rights.licenseAttribution-ShareAlike 3.0 Brazilen
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/br/
dc.subject.cnpqCIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA::FITOTECNIA
dc.subject.keywordCucumis Melo L.
dc.subject.keywordISSR
dc.subject.keywordRAPD
dc.subject.keywordCucurbitáceas
dc.subject.keywordmancha foliar
dc.subject.keywordCucumis Melo L.
dc.subject.keywordISSR
dc.subject.keywordRAPD
dc.subject.keywordCucurbitaceae
dc.subject.keywordleaf spot
dc.titleCaracterização morfológica e molecular de Cladosporium tenuissimum e efeito de óleos essenciais sobre seu crescimento in vitro
dc.title.alternativeMorphological and molecular characterization of Cladosporium tenuissimum and the effect of essential oils on its growth in vitro
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/doctoralThesis

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