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Estudo de diversidade genética de moscas-minadoras isoladas de cultivos comerciais de meloeiro utilizando marcadores ISSR

dc.contributor.advisorHolanda, Ioná Santos Araújo
dc.contributor.advisormailiona@ufersa.edu.br
dc.contributor.authorPitombeira, Izadora Cristina Romão
dc.contributor.referee1Holanda, Ioná Santos Araújo
dc.contributor.referee2Godoy, Maurício Sekiguchi de
dc.contributor.referee3Silva Neto, Jorge Alves da
dc.coverage.spatialMossoró
dc.date.accessioned2026-08-03T20:41:53Z
dc.date.available2026-08-03T20:41:53Z
dc.date.issued2025-07-23
dc.description.abstractMoscas-minadoras (Liriomyza spp.) são insetos dípteros consideradas pragas-chave do meloeiro. Os danos em culturas comerciais estão relacionados ao hábito herbívoro das larvas e a formação de puncturas pelas fêmeas, diminuindo a taxa fotossintética e o conteúdo de sólidos solúveis, comprometendo assim a produtividade. O sucesso das táticas de controle implementadas, como uso de químicos sintéticos e produtos biológicos, dependem diretamente da variação genética, que favorece a resistência a pressões seletivas. Dessa forma, estudar a diversidade genética é uma importante ferramenta para entender o sucesso de infestação e gerar novas informações para essas estratégias. O presente estudo teve como objetivo avaliar a diversidade e diferenciação genética em populações de moscas-minadoras isoladas de cultivos comerciais de melão amarelo na principal região produtora do Brasil, que é o Estado do Rio Grande do Norte, a partir de marcadores ISSR (Inter-simple sequence repeats). Neste sentido, folhas de meloeiro contendo larvas foram coletadas de fazendas localizadas em Mossoró-RN (ABJM), Baraúna-RN (ABAB) e Caraúbas-RN (AAGC) e foram encaminhadas ao Laboratório de Ecotoxicologia (LECT) à Artrópodes da UFERSA (Universidade Federal Rural do Semi-árido) para desenvolvimento até a fase adulta. Dez indivíduos de cada população tiveram seu DNA extraído a partir do método de Doyle e Doyle adaptado com SDS. Para amplificação via Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) foram utilizados 28 primers comerciais seguida da análise em gel de agarose, submetidos a eletroforese a 2% e corados com Brometo de Etídeo sob luz ultravioleta, com posterior registro das imagens em fotodocumentador para construção das matrizes binárias 0 e 1. Na análise de eficiência dos primers, os seguintes parâmetros foram avaliados: tamanho do fragmento (pb), número de fragmentos, número de fragmentos polimórficos, porcentagem de polimorfismo, conteúdo de informação polimórfica, razão multiplex efetiva e índice de marcador. A diversidade genética nas populações foi mensurada pelos índices de Nei e Shannon. O índice de similaridade entre indivíduos de Jaccard serviu para análise de agrupamento pelo método UPGMA na visualização gráfica, que também foi realizada pelo método de coordenadas principais (PCoA). Análise de variância molecular e índice de Mantel serviram para determinar a proporção de variação genética entre e dentro de populações e sua relação com as distâncias geográficas entre as fazendas. Como principais resultados encontrados, foi possível observar que houve sucesso na análise de PCR-ISSR a partir de 18 primers selecionados para análise do DNA de moscas-minadoras, com fragmentos gerados que variaram de 180 a 1800 pb e porcentagem de polimorfismo de 88%, indicando alta diversidade genética nas populações avaliadas. A análise UPGMA gerou três grupos distintos, com a proximidade clara entre indivíduos ABJM e ABAB. Com a população AAGC isolada em um grupo único, indicando relação, ainda que fraca, da diversidade genética com distâncias geográficas, demonstrada por Mantel (de r2 = 0,1709 e p < 0,05). A proximidade entre as elipses geradas por PCoA e valores de índices de Nei e Shannon, revelou baixa diferenciação entre as populações, confirmada por AMOVA que identificou proporções de variação interpopulacional de 12,34% e dentro das populações de 87,66%. Neste sentido, o presente estudo sugere que a alta diversidade genética existente justifica o sucesso de infestação frente a estratégias de controle. Contudo, devido a baixa diferenciação entre as populações, a partir da identificação de um método efetivo para uma área de produção, será passível de ser utilizado em outras regiões devido a possível fisiologia compartilhada, reforçando a necessidade e importância de pesquisas aprofundadas nessa área.
dc.description.abstract2Leafminer flies (Liriomyza spp.) are dipteran insects considered key pests of melon crops. Damage to commercial plantations is associated with the herbivorous behavior of the larvae and the puncture formation by females, which reduces photosynthetic rate and soluble solids content, thereby compromising productivity. The success of implemented control strategies, such as the use of synthetic chemicals and biological products, depends directly on genetic variation, which promotes resistance to selective pressures. Therefore, studying genetic diversity is an important tool to understand infestation success and generate new information to support these strategies. The present study aimed to assess the genetic diversity and differentiation among populations of leafminer flies collected from commercial yellow melon fields in Brazil’s main producing region, Rio Grande do Norte state, using ISSR (Inter-Simple Sequence Repeats) markers. In this context, melon leaves containing larvae were collected from farms located in Mossoró-RN (ABJM), Baraúna-RN (ABAB), and Caraúbas-RN (AAGC), and transferred to the Arthropod Ecotoxicology Laboratory (LECT) at UFERSA (Federal Rural University of the Semi-arid Region) for rearing to the adult stage. DNA was extracted from ten individuals using the Doyle and Doyle method adapted with SDS. For Polymerase Chain Reaction (PCR) amplification, 28 commercial primers were used. The PCR products were applied to agarose gel and subjected to 2% electrophoresis and stained with Ethidium Bromide. The gels were revealed in a UV photodocumenter. The absence and presence of fragments between the samples were converted into a binary data table 0 and 1. To check primer efficiency, the following parameters were evaluated: fragment size (bp), number of fragments, number of polymorphic fragments, percentage of polymorphism, polymorphic information content, effective multiplex ratio, and marker index. Genetic diversity among populations was measured using Nei’s and Shannon’s indices. Jaccard similarity index among individuals was used for cluster analysis through the UPGMA method for graphical visualization, which was also carried out using Principal Coordinates Analysis (PCoA). Molecular variance analysis (AMOVA) and Mantel test were used to determine the proportion of genetic variation among and within populations and its relationship with the geographic distances between farms. The main results showed that the PCR-ISSR analysis was successful using 18 selected primers for analyzing leafminer fly DNA, generating fragments ranging from 180 to 1800 bp and a polymorphism percentage of 88%, indicating high genetic diversity in the evaluated populations. The UPGMA analysis resulted in three distinct groups, with a clear proximity between ABJM and ABAB individuals. The AAGC population was isolated in a single group, indicating a weak relationship between genetic diversity and geographic distance, as demonstrated by the Mantel test (r² = 0.1709; p < 0.05). The proximity between PCoA-generated ellipses and values from Nei’s and Shannon’s indices revealed low differentiation among populations, which was confirmed by AMOVA, identifying interpopulation variation of 12.34% and intrapopulation variation of 87.66%. In this regard, the present study suggests that the existing high genetic diversity explains the infestation success in the face of control strategies. However, due to the low differentiation among populations, once an effective control method is identified for one farm, it may be applicable in other regions due to the likely shared physiology, reinforcing the need for further research in this area.
dc.description.physical54 f.
dc.format.mimetypepdf
dc.identifier.bibliographicCitationPITOMBEIRA, Izadora Cristina Romão. Estudo de diversidade genética de moscas-minadoras isoladas de cultivos comerciais de meloeiro utilizando marcadores ISSR. 2025. 54 f. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Biotecnologia), Universidade Federal Rural do Semi-Árido, Mossoró, 2025.
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufersa.edu.br/handle/prefix/15478
dc.language.isopt_BR
dc.publisher.centerCentro de Ciências Biológicas de Saúde - CCBS
dc.publisher.countryBrasil
dc.publisher.initialsUFERSA
dc.publisher.institutionUniversidade Federal Rural do Semi-árido
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.holderUFERSA
dc.rights.licenseAttribution-ShareAlike 3.0 Brazilen
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/br/
dc.subject.cnpqCIENCIAS BIOLOGICAS::BIOTECNOLOGIA
dc.subject.keywordLiriomyza spp
dc.subject.keywordBiotecnologia
dc.subject.keywordGenética Molecular
dc.subject.keywordCucumis melo
dc.subject.keywordMosca minadora
dc.subject.keywordInseto díptero
dc.subject.keywordMelão amarelo
dc.subject.keywordDiferenciação genética
dc.subject.keywordGel de agarose
dc.titleEstudo de diversidade genética de moscas-minadoras isoladas de cultivos comerciais de meloeiro utilizando marcadores ISSR
dc.title.alternativeGenetic diversity study of leafminers isolated from commercial melon crops using ISSR markers
dc.typeinfo:eu-repo/semantics/bachelorThesis

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