Metodologia para análise metagenômica de bactérias do semiárido relacionadas à formação de nuvens

Abstract

A metagenômica é uma estratégia que nos permite o acesso ao potencial genômico de amostras ambientais, permitindo a análise de DNA ambiental sem a necessidade de cultivo dos micro-organismos. Essa abordagem pode ser utilizada para avaliar a presença dos genes dmdA que codificam a enzima DMSP Lias. Essa enzima catalisa o gás sulfonilpropionato de dimetila (DMSP) que será biotransformado em sulfeto de dimetila (DMS) auxiliando, assim, na produção de nuvens em determinada região. Buscando-se entender se há relação entre a diversidade microbiana e de genes que codificam a enzima DMSP liase, foram realizadas extrações de DNA metagenômico de solo em três regiões de Mossoró (RN - Brasil) sendo a primeira no bairro Aeroporto de Mossoró (local com menos vegetação – duas amostras), a segunda próxima ao Rio Apodi-Mossoró (local de maior vegetação – duas amostras) e a terceira nas proximidades da cidade de Areia Branca (região de maior salinidade – duas amostras), com o objetivo de se estabelecer um protocolo de extração do DNA das amostras e amplificação dos genes dmdA e 16S rDNA. Ao término dos experimentos, conseguiu-se desenvolver protocolos para extração de DNA metagenômico tanto do solo quanto da água do mar, que serviu como controle positivo em relação aos genes, e padronização da amplificação do 16S rDNA.